Vitamin D3 je jedním z vitamínů, u nichž může mít nedostatek závažné účinky. Děti, které ve své stravě nemají dostatek vitaminu D3, jsou vystaveny zvýšenému riziku vzniku křivice, což je onemocnění, které u dětí způsobuje malformace kostí a zubů.
U dospělých s nízkou hladinou vitaminu D3 je větší pravděpodobnost vzniku osteomalácie (podobné křivici) a trpí osteoporózou, onemocněním oslabujícím kosti. Může být široce používán v lékařských doplňcích, výživě, potravinářských a krmných přísadách atd.